ลำดับ 66 คือคำสั่งอธิการบดี Palpatine ให้กองทัพแห่งสาธารณรัฐใน ตอนที่สาม: การแก้แค้นของ Sith มันเป็นหนึ่งในหลาย ๆ คำสั่งฉุกเฉินที่มอบให้กับ Clone Troopers ซึ่งพวกเขาได้รับการฝึกฝนให้ปฏิบัติตามโดยไม่มีคำถามในกรณีฉุกเฉิน ลำดับ 66 ซึ่งสามารถสั่งการได้โดยตรงจาก Palpatine สั่งให้ Clone Troopers ฆ่าหัวหน้าเจได คำสั่งที่ชัดเจนเพื่อป้องกันไม่ให้เจไดขัดกับสาธารณรัฐลำดับ 66 เป็นแผนของ Palpatine ในการกำจัดคำสั่งเจไดเพื่อให้ Sith สามารถใช้อำนาจได้

ในจักรวาล: คำสั่ง 66 รัฐ:

ในกรณีที่เจ้าหน้าที่เจไดที่ทำหน้าที่ต่อต้านผลประโยชน์ของสาธารณรัฐและหลังจากได้รับคำสั่งเฉพาะที่ยืนยันว่ามาโดยตรงจากผู้บัญชาการทหารสูงสุด (อธิการบดี) ผู้บัญชาการ GAR จะลบเจ้าหน้าที่เหล่านั้นออกด้วยกำลังทหารและผู้บัญชาการของ GAR จะกลับไปเป็น ผู้บัญชาการทหารสูงสุด (นายกรัฐมนตรี) จนกว่าจะมีการกำหนดโครงสร้างคำสั่งใหม่

เมื่อมีการออกคำสั่ง 66 จำนวนทหารโคลนเชื่อว่ามันเป็นคำสั่งที่ผิดและเริ่มปกป้องเจไดแทนที่จะฆ่าพวกเขา เจไดอีกหลายคนรอดชีวิตมาได้จากการฆ่าทหารโคลนโจมตี

ดาร์ ธ เวเดอร์นำการรณรงค์เพื่อตามล่าและสังหารผู้รอดชีวิตส่วนใหญ่ในช่วงหลายปีที่ผ่านมาตามคำสั่งที่ 66 การทำลายล้างของเจไดที่ยิ่งใหญ่นี้เป็นที่รู้จักกันในชื่อ Great Jedi Purge เจไดกว่า 100 คนและอดีตเจไดได้หลบซ่อนตัวและรอดชีวิตจากการถูกกวาดล้างทั้งหมด ตัวอย่างเช่นโยดาและโอบิวันเคโนบีรอดชีวิตจากการถูกเนรเทศบนดาวเคราะห์ระยะไกลของดาโกบาห์และทาทูอีน